萧崇业(?-1588年),字允修,号乾养,明朝政治人物。云南建水县人。
萧崇业祖籍南直隶。洪武年间其祖奉命迁云南,遂落籍建水。崇业自幼好学,嘉靖四十年(1561年)中举人。隆庆五年(1571年)成进士,点翰林院庶吉士。历官户科、工科左、右给事中,兵科都给事中。万历四年(1576年)以正使出使琉球国,册封尚永王,期间著《使琉球录》。升光禄寺少卿、太常寺少卿。