梵蒂冈国旗由两个面积相等的竖长方形组成,靠旗杆侧为黄色,另一侧则为白色。白色上还绘有教宗的牧徽:两把交叉的圣伯多禄的钥匙和一顶教宗的三重冕。黄白两色是耶稣十二宗徒之长圣伯多禄的两把钥匙的颜色,代表了两种最珍贵的金属:金与银。教宗的牧徽则是至高无上地位的象征。
旗上的金黄和银白色是自1808年2月以来教廷卫兵瑞士卫队帽徽的颜色。于1825年时教宗良十二世订定这面旗帜。1929年2月11日,意大利与教宗庇护十一世签订《拉特兰条约》。教宗正式承认教宗国的灭亡,另建梵蒂冈城国。梵蒂冈国旗是以早期的教皇国国旗为蓝本。