邓子新（1957年3月－），中国微生物学家。武汉大学教授。生于湖北房县。1982年毕业于华中农业大学微生物专业，1987年获英国东英吉利亚大学分子微生物学博士学位。1988年起任教于华中农业大学，历任讲师、副教授、教授；2000年起任教于上海交通大学，后担任上海交通大学微生物代谢教育部重点实验室主任、Bio-X生命科学研究中心副主任。2010年5月任武汉生物技术研究院院长，2010年6月任武汉大学药学院院长。2005年当选为中国科学院院士；2006年当选为第三世界科学院院士；2010年当选为美国微生物科学院院士。
