词条 分子建模

分子建模

分子建模(英语:Molecular modelling)或称分子模拟,是指利用理论方法与计算技术,模拟出化学分子的外观或性质,属于计算化学与计算生物学领域的研究对象。并且是化学与生物学上,如结构生物学等学门所应用的研究方法。

分子建模相关文献
分子
历史约翰·道尔顿分子的概念最早是由意大利的阿莫迪欧·阿伏伽德罗提出,他于1811年发表了分子学说,认为:“原子是参加化学反应的最小质点,分子则是在游离状态下单质或化合物能够独立存在的最小质点。分子是由原子组成的,单质分子由相同元素的原子组成,化合物分子由不同元素的原子组成。在化学变化中,不同物质的分子中各种原子进行重新结合。”在阿伏伽德罗之前,化学家约翰·道尔顿在1803年及1811年提出的定比定律及倍比定律,也支持分子学说,因此许多化学家接受分子学说。可是许多逻辑实证主义者及像恩斯特·马赫、路德维希·玻尔兹曼、詹姆斯·麦克斯韦、约西亚·吉布斯等物理学家不接受分子学说,认为分子只是一种方便处理的数学结构,不是实际存在的物质。一直到让·佩兰在布朗运动相关的研究中,才证实了分子学说。特性分子大小大部分的分子无法借由电子显微镜看见,最小的分子是H2,其键长为0.74Å。有机合成中常用到的分子大小
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分子演化
发展史分子演化发源自20世纪初的“比较生物化学”,在1960至70年代成形。蛋白质定序技术的发展让分子生物学家得以用序列比对来进行种系发生的研究,并用同源序列的差异程度建立分子时钟来推估最后共同祖先的存在时间。1960年代末,中性理论的发展让分子时钟有了理论基础,并和主张自然选择是主要演化动力的学者们产生激烈争辩。1970年代,核酸定序的技术让分子演化进一步推展到高度保守的核糖体RNA,让生物学家可以推论早期的生命演化史。早期在分子生物学于1950~1960年代成形之前,透过比较物种间的生化差异来研究演化的可能性只有少数生物学家探究过。艾弗德·史都特方(AlfredSturtevant)在1921年预测到染色体反转,并和费奥多西·多布然斯基在1937年首次在DrosophilaPseudo-obscura果蝇中用染色体反转的数量重建了17个品系的种系发生史。厄尼斯特·鲍德温(ErnestB...
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分子建模
分子建模软件AgileMoleculeBALLViewCerius2GAUSSIANGhemicalGROMOSInsightIIMarvinSpaceMMTKMOEMolsoftICMNOCHOscailXPyMOLSiriusSPARTANSybylVMDWHATIF参见分子影像参考文献A.R.Leach,MolecularModelling:PrinciplesandApplications,2001,ISBN0-582-38210-6D.Frenkel,B.Smit,UnderstandingMolecularSimulation:FromAlgorithmstoApplications,1996,ISBN0-12-267370-0D.C.Rapaport,TheArtofMolecularDynamicsSimulation,2004,ISBN0-521-82586-7R.J.S...
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超分子
相关条目超分子化学分子自组装(英语:Molecularself-assembly)超分子组装高分子
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统一建模语言
模型类别图显示一般化关系一对多(多维)的实现在UML系统开发中有三个主要的模型:功能模型:从用户的角度展示系统的功能,包括用例图。对象模型:采用对象,属性,操作,关联等概念展示系统的结构和基础,包括类别图、对象图。动态模型:展现系统的内部行为。包括序列图,活动图,状态图。区分UML模型和UML图是非常重要的,UML图,包括用例图、协作图、活动图、序列图、部署图、构件图、类图、状态图,是模型中信息的图形表达方式,但是UML模型独立于UML图存在。UML的当前版本只提供了模型信息的交换,而没有提供图信息的交换。UML使用一套与Java语言或其他面向对象语言等价物,同时也是本体论等价物的图形标记。UML并不是一个方法学,也不要求使用一个方法学,但是UML对于Rational统一过程来说是必不可少的。图形UML2.0使用个案图实例状态图实例UML2.2中一共定义了14种图示(diagrams)。为...
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生物信息学
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78.鹤山夏氏宗谱, 78, 卷53, 树林分子贵公支下世系世传 13世正经公起, 1991
原书: [出版地不详] : 会稽堂, 1991年修. 85册 : 插图, 世系表, 人像. 注 : 此谱不全. 缺胜分卷首1, 洪分卷首3, 鲁分卷首1, 树林分卷首2, 卷29. 熙分缺1-5世世系及世传. 远祖 : 夏远,字光庭,号三斗. 原籍浙江会稽. 生三子 : 夏雀? ; 夏深 ; 夏洪,字显清,行三. 迁江州德化常乐里敷平乡水落镇. 宗祖 : 夏正五,行二. 生三子 : 夏德一(居野鹤山,本派始祖) ; 夏德二(居𥐛石岑) ; 夏德三(居鄱塘湖). 野鹤山始祖(1世) : (元明之际) 夏德一,行一,更名得乙. 远公19世孙. 原籍江西省饶州府乐平县. 武洪8年偕弟德二公(居翠石岭) ; 德三公(后解千一公迁夏树林)来蕲. 德一公生五子 : 夏世杰,行一(杰分) ; 夏世仲,行二 ; 夏世偪 ; 夏世倡 ; 夏世侣(侣分). 世仲公下房祖(4世) : 夏思熙,字照亭,行一(熙分) ; 夏思胜,字悟新,行二(胜分) ; 夏思洪,行五(洪分) ; 夏思珩,行八(珩分) ; 夏思鲁,行十(鲁分). 树林1世祖 : 夏千一. 由江西南康府星子县谢事塘,自元季卜居楚北黄州府蕲水县𥐛石潭夏家港. 排行字 : 德世鼎思玉 单天亨继时 乘观国之光 象贤士学起 (继20世) 述志联宗绍 商山源本同 家声知必大 永代庆昌隆. 注 : 排行字母表见卷首六第49页(影像51). 散居地 : 湖北省浠水县野鹤山村等地. 书名据书衣题编目. 版心题 : 鹤山夏氏四修宗谱
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81.鹤山夏氏宗谱, 81, 卷56, 树林分子贵公支下世系世传 21世述昌公起, 1991
原书: [出版地不详] : 会稽堂, 1991年修. 85册 : 插图, 世系表, 人像. 注 : 此谱不全. 缺胜分卷首1, 洪分卷首3, 鲁分卷首1, 树林分卷首2, 卷29. 熙分缺1-5世世系及世传. 远祖 : 夏远,字光庭,号三斗. 原籍浙江会稽. 生三子 : 夏雀? ; 夏深 ; 夏洪,字显清,行三. 迁江州德化常乐里敷平乡水落镇. 宗祖 : 夏正五,行二. 生三子 : 夏德一(居野鹤山,本派始祖) ; 夏德二(居𥐛石岑) ; 夏德三(居鄱塘湖). 野鹤山始祖(1世) : (元明之际) 夏德一,行一,更名得乙. 远公19世孙. 原籍江西省饶州府乐平县. 武洪8年偕弟德二公(居翠石岭) ; 德三公(后解千一公迁夏树林)来蕲. 德一公生五子 : 夏世杰,行一(杰分) ; 夏世仲,行二 ; 夏世偪 ; 夏世倡 ; 夏世侣(侣分). 世仲公下房祖(4世) : 夏思熙,字照亭,行一(熙分) ; 夏思胜,字悟新,行二(胜分) ; 夏思洪,行五(洪分) ; 夏思珩,行八(珩分) ; 夏思鲁,行十(鲁分). 树林1世祖 : 夏千一. 由江西南康府星子县谢事塘,自元季卜居楚北黄州府蕲水县𥐛石潭夏家港. 排行字 : 德世鼎思玉 单天亨继时 乘观国之光 象贤士学起 (继20世) 述志联宗绍 商山源本同 家声知必大 永代庆昌隆. 注 : 排行字母表见卷首六第49页(影像51). 散居地 : 湖北省浠水县野鹤山村等地. 书名据书衣题编目. 版心题 : 鹤山夏氏四修宗谱
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82.鹤山夏氏宗谱, 82, 卷57, 树林分子先祖支下世系世传 5世思敬公起, 1991
原书: [出版地不详] : 会稽堂, 1991年修. 85册 : 插图, 世系表, 人像. 注 : 此谱不全. 缺胜分卷首1, 洪分卷首3, 鲁分卷首1, 树林分卷首2, 卷29. 熙分缺1-5世世系及世传. 远祖 : 夏远,字光庭,号三斗. 原籍浙江会稽. 生三子 : 夏雀? ; 夏深 ; 夏洪,字显清,行三. 迁江州德化常乐里敷平乡水落镇. 宗祖 : 夏正五,行二. 生三子 : 夏德一(居野鹤山,本派始祖) ; 夏德二(居𥐛石岑) ; 夏德三(居鄱塘湖). 野鹤山始祖(1世) : (元明之际) 夏德一,行一,更名得乙. 远公19世孙. 原籍江西省饶州府乐平县. 武洪8年偕弟德二公(居翠石岭) ; 德三公(后解千一公迁夏树林)来蕲. 德一公生五子 : 夏世杰,行一(杰分) ; 夏世仲,行二 ; 夏世偪 ; 夏世倡 ; 夏世侣(侣分). 世仲公下房祖(4世) : 夏思熙,字照亭,行一(熙分) ; 夏思胜,字悟新,行二(胜分) ; 夏思洪,行五(洪分) ; 夏思珩,行八(珩分) ; 夏思鲁,行十(鲁分). 树林1世祖 : 夏千一. 由江西南康府星子县谢事塘,自元季卜居楚北黄州府蕲水县𥐛石潭夏家港. 排行字 : 德世鼎思玉 单天亨继时 乘观国之光 象贤士学起 (继20世) 述志联宗绍 商山源本同 家声知必大 永代庆昌隆. 注 : 排行字母表见卷首六第49页(影像51). 散居地 : 湖北省浠水县野鹤山村等地. 书名据书衣题编目. 版心题 : 鹤山夏氏四修宗谱
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85.鹤山夏氏宗谱, 85, 卷60, 树林分子先祖支下世系世传 21世述泉公起, 1991
原书: [出版地不详] : 会稽堂, 1991年修. 85册 : 插图, 世系表, 人像. 注 : 此谱不全. 缺胜分卷首1, 洪分卷首3, 鲁分卷首1, 树林分卷首2, 卷29. 熙分缺1-5世世系及世传. 远祖 : 夏远,字光庭,号三斗. 原籍浙江会稽. 生三子 : 夏雀? ; 夏深 ; 夏洪,字显清,行三. 迁江州德化常乐里敷平乡水落镇. 宗祖 : 夏正五,行二. 生三子 : 夏德一(居野鹤山,本派始祖) ; 夏德二(居𥐛石岑) ; 夏德三(居鄱塘湖). 野鹤山始祖(1世) : (元明之际) 夏德一,行一,更名得乙. 远公19世孙. 原籍江西省饶州府乐平县. 武洪8年偕弟德二公(居翠石岭) ; 德三公(后解千一公迁夏树林)来蕲. 德一公生五子 : 夏世杰,行一(杰分) ; 夏世仲,行二 ; 夏世偪 ; 夏世倡 ; 夏世侣(侣分). 世仲公下房祖(4世) : 夏思熙,字照亭,行一(熙分) ; 夏思胜,字悟新,行二(胜分) ; 夏思洪,行五(洪分) ; 夏思珩,行八(珩分) ; 夏思鲁,行十(鲁分). 树林1世祖 : 夏千一. 由江西南康府星子县谢事塘,自元季卜居楚北黄州府蕲水县𥐛石潭夏家港. 排行字 : 德世鼎思玉 单天亨继时 乘观国之光 象贤士学起 (继20世) 述志联宗绍 商山源本同 家声知必大 永代庆昌隆. 注 : 排行字母表见卷首六第49页(影像51). 散居地 : 湖北省浠水县野鹤山村等地. 书名据书衣题编目. 版心题 : 鹤山夏氏四修宗谱
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84.鹤山夏氏宗谱, 84, 卷59, 树林分子先祖支下世系世传 17世祈贤公起, 1991
原书: [出版地不详] : 会稽堂, 1991年修. 85册 : 插图, 世系表, 人像. 注 : 此谱不全. 缺胜分卷首1, 洪分卷首3, 鲁分卷首1, 树林分卷首2, 卷29. 熙分缺1-5世世系及世传. 远祖 : 夏远,字光庭,号三斗. 原籍浙江会稽. 生三子 : 夏雀? ; 夏深 ; 夏洪,字显清,行三. 迁江州德化常乐里敷平乡水落镇. 宗祖 : 夏正五,行二. 生三子 : 夏德一(居野鹤山,本派始祖) ; 夏德二(居𥐛石岑) ; 夏德三(居鄱塘湖). 野鹤山始祖(1世) : (元明之际) 夏德一,行一,更名得乙. 远公19世孙. 原籍江西省饶州府乐平县. 武洪8年偕弟德二公(居翠石岭) ; 德三公(后解千一公迁夏树林)来蕲. 德一公生五子 : 夏世杰,行一(杰分) ; 夏世仲,行二 ; 夏世偪 ; 夏世倡 ; 夏世侣(侣分). 世仲公下房祖(4世) : 夏思熙,字照亭,行一(熙分) ; 夏思胜,字悟新,行二(胜分) ; 夏思洪,行五(洪分) ; 夏思珩,行八(珩分) ; 夏思鲁,行十(鲁分). 树林1世祖 : 夏千一. 由江西南康府星子县谢事塘,自元季卜居楚北黄州府蕲水县𥐛石潭夏家港. 排行字 : 德世鼎思玉 单天亨继时 乘观国之光 象贤士学起 (继20世) 述志联宗绍 商山源本同 家声知必大 永代庆昌隆. 注 : 排行字母表见卷首六第49页(影像51). 散居地 : 湖北省浠水县野鹤山村等地. 书名据书衣题编目. 版心题 : 鹤山夏氏四修宗谱
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80.鹤山夏氏宗谱, 80, 卷55, 树林分子贵公支下世系世传 17世祈龄公起, 1991
原书: [出版地不详] : 会稽堂, 1991年修. 85册 : 插图, 世系表, 人像. 注 : 此谱不全. 缺胜分卷首1, 洪分卷首3, 鲁分卷首1, 树林分卷首2, 卷29. 熙分缺1-5世世系及世传. 远祖 : 夏远,字光庭,号三斗. 原籍浙江会稽. 生三子 : 夏雀? ; 夏深 ; 夏洪,字显清,行三. 迁江州德化常乐里敷平乡水落镇. 宗祖 : 夏正五,行二. 生三子 : 夏德一(居野鹤山,本派始祖) ; 夏德二(居𥐛石岑) ; 夏德三(居鄱塘湖). 野鹤山始祖(1世) : (元明之际) 夏德一,行一,更名得乙. 远公19世孙. 原籍江西省饶州府乐平县. 武洪8年偕弟德二公(居翠石岭) ; 德三公(后解千一公迁夏树林)来蕲. 德一公生五子 : 夏世杰,行一(杰分) ; 夏世仲,行二 ; 夏世偪 ; 夏世倡 ; 夏世侣(侣分). 世仲公下房祖(4世) : 夏思熙,字照亭,行一(熙分) ; 夏思胜,字悟新,行二(胜分) ; 夏思洪,行五(洪分) ; 夏思珩,行八(珩分) ; 夏思鲁,行十(鲁分). 树林1世祖 : 夏千一. 由江西南康府星子县谢事塘,自元季卜居楚北黄州府蕲水县𥐛石潭夏家港. 排行字 : 德世鼎思玉 单天亨继时 乘观国之光 象贤士学起 (继20世) 述志联宗绍 商山源本同 家声知必大 永代庆昌隆. 注 : 排行字母表见卷首六第49页(影像51). 散居地 : 湖北省浠水县野鹤山村等地. 书名据书衣题编目. 版心题 : 鹤山夏氏四修宗谱
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