荧光光谱原理

设分子能级为基态S a ，激发态S b 。

分子在能级S a 和S b 上的分布按照波尔兹曼分布规律：

基态上分子数目变化速率为

平衡时（稳定态），上式为0： 又有：

迁移几率（爱因斯坦系数）

偶极强度

频率ν处的入射光强

推导出： S b 通过发射光子从回到S a 的几率，即衰减常数λ

S b 上的分子去激发速率

上式的一个解为

可见激发态上的分子数目以指数形式衰减，衰减常数为A ba S b 的辐射寿命为（此处参考指数衰减）

此仅当吸收的光子和随后发射的光子相同时候有效，即全部吸收的光能量通过辐射过程全部发出光子消耗掉。 而实测时激发态寿命很少和上述寿命一致，因为激发态除了直接发射光子外有很多其他途径失去能量。

S b 通过发出荧光回到S a 的过程的反应速率，即固有荧光速率常数 k F

S b 回到S a 的其他非辐射途径包括内转变，系统间转变，猝熄作用，其速率常数分别为k IC ,k IS ,k Q [Q] 则S b 总的去激化（熄灭）常数为k F +k IC +k IS +k Q [Q]

荧光量子产率

也可以写作发射光子数/吸收光子数，即发射的荧光光子数/入射光照射时的吸收量

因为大量的非辐射过程的存在，所以激发态实际衰减时间远小于理想的辐射寿命τ R 描述此动力学过程

此方程的一个解为

S b 是激发态上的分子数

斯托克斯位移

吸收曲线的0,0跃迁与发射曲线的0,0跃迁不重合，之间有一位移，荧光光谱较相应的吸收光谱红移。 原因是分子在处于激发态期间进行了重定向/重排布，消耗了能量，故荧光光谱的0,0峰向低能量（高波长）方向平移。

荧光强度

得到

观测发射强度为

k=2.303ld

给一束脉冲入射光后，发射光在脉冲后的时间t时的强度I(t)，与激发态的衰减率dS b /dt及激发态通过荧光衰减的比率φ F （量子产率）成比例：

随时间表现为指数衰减

系统内有一种荧光物质时：

系统中有两种荧光物质时：

Em是荧光强度，上述公式为荧光衰减（decay)公式

内部滤光效应

对高浓度溶液而言，荧光的再吸收不能忽略。大部分入射光在系统前半部分被吸收，发射的荧光被再吸收，只有少量的荧光通过狭缝入射到荧光探测器上，使得探测到的荧光强度减少。

外环境影响

去激发同样可能由于碰撞或和溶剂分子的混合导致，以速率k Q [Q]发生。和其他过程不同，考虑碰撞时此猝熄是一个双分子过程。 S b + Q → S a + Q (k Q [Q])

因为Q通常浓度远大于S b ，此过程被视为一个伪一级反应，k Q [Q]的值可通过变化猝熄剂Q的浓度，观察对φ F 的影响测得。芳香类发色基的辐射寿命通常为1*10 到100*10 秒。因此，相比较而言，猝熄过程是相当有效率的。普遍的猝熄剂如O 2 和I 离子，每和激发态分子碰撞一次就会使其去激发一次。此反应速率仅被扩散限制。在微摩尔浓度猝熄剂下，碰撞发生速率为10 每秒，因此可以观察到明显的猝熄。

τ 0 可测，以F 0 /F对[Q]作图求得k Q

荧光共振能量迁移

简称FRET，此过程适用与计算两端带发色基的高分子长度。

存在供体D和受体A，当光入射时，激发基态供体Da→Db，Db又去激发，通过共振将能量传递给Aa，使得Aa→Ab。

定义迁移效率（E）是Db去激发传递能量到Aa占总Db去激发的比例

通过一系列复杂的计算和变化，此处省略，得：

推导出：

这里R 0 对一个固定的化学系统而言是常数，R是供体和受体之间的距离，R越接近R 0 ，测计算越精确。

此外计算E的方法有：

参考文献

C.P Cantor & P.R. Schimmel, BIOPHYSICAL CHEMISTRY, Part II. Techniques for the study of biological structure and function. Page 433-465.

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